c++教程 kegg分析結(jié)果怎么用?
kegg分析結(jié)果怎么用?KEGG一般采用條形圖、點圖或棒棒糖圖顯示。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中如何找GO富集分析上下調(diào)基因?如何從轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)判斷KEGG富集的意義?提取樣品總RNA后,用帶有oligo(DT)的
kegg分析結(jié)果怎么用?
KEGG一般采用條形圖、點圖或棒棒糖圖顯示。
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中如何找GO富集分析上下調(diào)基因?
如何從轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)判斷KEGG富集的意義?提取樣品總RNA后,用帶有oligo(DT)的磁珠富集真核細胞mRNA(對于原核生物,用試劑盒去除rRNA,然后進行下一步)。
添加片段緩沖液以將mRNA破碎成短片段。以mRNA為模板,用隨機六聚體合成第一條cDNA鏈。然后加入緩沖液、dNTPs、rna酶H和DNA聚合酶I合成第二條cDNA鏈,用qaquick法合成第二條cDNA鏈,純化PCR試劑盒,加入EB緩沖液洗脫,末端修復(fù),A+DNA測序,瓊脂糖凝膠電泳選擇片段大小。最后進行PCR擴增,并用Illumina HiSeq 2000對測序文庫進行測序。
go和kegg富集分析有什么作用?
Go和KEGG富集分析主要是研究差異表達基因的功能鑒定,從而探討不同操作的生物學(xué)意義。