引物怎么自己設計呢 caps標記和indel標記的區(qū)別?
caps標記和indel標記的區(qū)別?Indel(插入-缺失)標記是指整個基因組中兩個親本之間的差異。與另一個親本相比,一個親本在基因組中有一定數量的核苷酸插入或缺失(Jander等人,2002)。根據
caps標記和indel標記的區(qū)別?
Indel(插入-缺失)標記是指整個基因組中兩個親本之間的差異。與另一個親本相比,一個親本在基因組中有一定數量的核苷酸插入或缺失(Jander等人,2002)。根據基因組中的插入和缺失位點,設計了一些PCR引物對這些插入和缺失位點進行擴增,這些位點是InDel標記。Caps標記:SNP-PCR技術與RFLP技術相結合的分子標記技術。簡單的理解是SNP僅僅位于酶消化的位點。通過設計SNP位點的引物,將PCR得到的相應產物片段經酶切、電泳等步驟進行消化,最后通過觀察不同條帶來判斷樣品的多態(tài)性。/Source network
在PubMed網站上找到相應的基因mRNA序列,復制到引物設計軟件(如primer)軟件會設計不同的正負鏈引物,選擇合適的一個(得分較高),復制到PubMed網站,下拉列表中有一個PubMed blast。粘貼軟件設計的前后引物,通過搜索結果判斷引物是否正確、特異。