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差異基因熱圖制作 基因芯片熱圖怎么看?

基因芯片熱圖怎么看?我不太熟悉。我們說點(diǎn)什么吧。1.左邊的文字應(yīng)該是基因編號(hào),熱圖的每一行代表一個(gè)基因(或mRNA?)。2.下面的文字應(yīng)該是樣本編號(hào),熱圖的每一列代表一個(gè)樣本。3.上面的樹結(jié)構(gòu)表示樣本

基因芯片熱圖怎么看?

我不太熟悉。我們說點(diǎn)什么吧。1.左邊的文字應(yīng)該是基因編號(hào),熱圖的每一行代表一個(gè)基因(或mRNA?)。2.下面的文字應(yīng)該是樣本編號(hào),熱圖的每一列代表一個(gè)樣本。3.上面的樹結(jié)構(gòu)表示樣本之間的相似關(guān)系。例如,從左到右,樣本1和樣本2的圖案最相似,樣本3和樣本4的圖案也相似。。。例如,一個(gè)或兩個(gè)是兄弟,三個(gè)或四個(gè)是姐妹。這四個(gè)都是同一個(gè)家庭的孩子,五個(gè)是他們的表親。而六、七、八到另一代,是爺爺?shù)母绺纾ㄊ迨澹O子。再往右一點(diǎn),我們相距很遠(yuǎn)。左側(cè)8個(gè)樣本和右側(cè)11個(gè)樣本被分為兩組,兩組之間有顯著性差異。4.右邊的樹結(jié)構(gòu)代表基因間的相似關(guān)系。原因與上述類似。結(jié)果相似基因可能位于同一染色體上,也可能是受同一轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的mRNA。

如何利用Graphpad prism7.0軟件做熱圖?

1. 單擊graphpad prism 7.0軟件,如圖所示。

2. 用分組替換XY。如圖所示。

3. 單擊“熱量貼圖”和“創(chuàng)建”以開始繪制熱量貼圖。

4. 接下來,在“分組”下的列中輸入要研究的基因的名稱,然后在“分組的表格格式”下輸入分組的名稱。如下圖所示。

5. 單擊左側(cè)圖形下的data1以打開以下對(duì)話框。

6. 這里有幾種形式的熱圖。你可以選擇你想要的形式。這是第四個(gè)。

7. 單擊“確定”,將顯示所需的結(jié)果。