如何進行引物設(shè)計？如果這對通用引物沒有信號，就意味著這兩個位置有SNP，導(dǎo)致沒有擴增?？梢詤⒖紟追N方法。1：你可能知道這種細(xì)菌的種類和屬，所以去NCBI找到相關(guān)種類的16S序列，做序列比對，設(shè)計簡并引

如何進行引物設(shè)計？

如果這對通用引物沒有信號，就意味著這兩個位置有SNP，導(dǎo)致沒有擴增?？梢詤⒖紟追N方法。

1：你可能知道這種細(xì)菌的種類和屬，所以去NCBI找到相關(guān)種類的16S序列，做序列比對，設(shè)計簡并引物，擴增全長，然后測序。

2：你根本不了解物種。你可以在網(wǎng)上找到更多的入門知識。最好放大v3v4區(qū)或V4區(qū)。在放大了其中一些之后，你可以對它們進行排序和比較。一般來說，你可以確認(rèn)屬，然后按照1的方法。

3:如果部分序列可以通過方法2擴增，但全長引物未能擴增，則將獲得的部分序列用作race。

4:以上所有操作均失敗。第二代的DNA被提取和測序，基因組被直接測量（如果你認(rèn)為成本太高，你可以減少數(shù)據(jù)量進行比較）。