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mega怎么做進化樹 構建進化樹里內群外群怎么弄?

構建進化樹里內群外群怎么弄?系統(tǒng)發(fā)育樹通常有無根樹和有根樹。如果一棵有根的樹被建造,則需要外類群。所謂外類群是與你所研究的序列密切相關的序列,外類群可以很好地聚集成一個分支(如果外類群中有多個序列)。

構建進化樹里內群外群怎么弄?

系統(tǒng)發(fā)育樹通常有無根樹和有根樹。如果一棵有根的樹被建造,則需要外類群。所謂外類群是與你所研究的序列密切相關的序列,外類群可以很好地聚集成一個分支(如果外類群中有多個序列)。如果研究進化史,應選擇進化史早于目標序列的序列作為外類群。

建議您看一看這本書:分子進化和系統(tǒng)發(fā)育學,其中詳細介紹了這方面的內容。

一般來說,沒有嚴格的區(qū)分標準。

細菌16S rDNA序列分析以后,怎么構建進化樹?

下載軟件或在線構建軟件的方法很多。在線構建可以將您的序列輸入PubMed blast n進行比較。其中一個結果是系統(tǒng)發(fā)育樹,但有太多的序列留在它的比較。按相反順序選擇。有很多軟件,最簡單的是DNAStar中的megalin,但結果很粗糙。建議使用clustalx軟件進行同源性比較,然后使用mega3.0軟件進行系統(tǒng)發(fā)育分析,繪制系統(tǒng)發(fā)育樹。這也是非常簡單和容易看到的解釋。Philip系列軟件被普遍認為是嚴謹?shù)模洳僮魇菑碗s的。