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gsea圖怎么看 GSEA分析是個(gè)什么鬼?

GSEA分析是個(gè)什么鬼?GSEA,基因探針富集分析,是基于評(píng)估來自微陣列的數(shù)據(jù)的各級(jí)別基因探針。 GSEA的初始版本是用來分析糖尿病人與正常人的肌肉活組織采樣數(shù)據(jù)。分析顯示,有某些基因牽涉到糖尿病人的

GSEA分析是個(gè)什么鬼?

GSEA,基因探針富集分析,是基于評(píng)估來自微陣列的數(shù)據(jù)的各級(jí)別基因探針。 GSEA的初始版本是用來分析糖尿病人與正常人的肌肉活組織采樣數(shù)據(jù)。分析顯示,有某些基因牽涉到糖尿病人的氧化磷酸化作用的減弱,而其他獨(dú)立的微陣列研究和活體功能研究中也證實(shí)了這個(gè)結(jié)果。 GSEA的使用方法是,使用者利用在權(quán)威刊物上發(fā)表過的相關(guān)生物學(xué)通路和實(shí)驗(yàn)得來的共表達(dá)數(shù)據(jù),把基因探針分門別類,并根據(jù)相關(guān)性通過一系列運(yùn)算,得出探針集是否能在表型上揭示出相關(guān)基因組的分布方式。

只有g(shù)enelist怎樣做gsea分析實(shí)驗(yàn)?

您好,我來為您解答:

  只有g(shù)ene list的話,只能嘗試其他Functional Classification/enrichment方法,比如DAVID及基于GO的TANGO,BiNGO,GoMiner GOstat等。

  希望我的回答對(duì)你有幫助。